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航海学院的前身是爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1920年创办的集美航海学校。1989年5月经国家教委批准升格为集美航海学院，1994年报10月并入集美大学。
　　航海学院是我国高等航海教育和船员培训的重要基地之一，学院现有航海技术、交通运输两个本科专业。办学八十多年来，在交通部、福建省和厦门市政府的高度重视和厦门市政府的高度重视和支持下航海教育为基础的交通运输工程学科初步形成，其航海技术、交通运输专业为省内所独有的本科专业，突出海上交通运输特色，为我国航运企事业单位培养了大批高素质的应用型人才，在国内以及东南亚具有相当影响，被誉为“航海家的摇篮”。学院现有教职工人数102人。其中：教师48人；实验技术人员31人。教授8人，副教授18人；高级实验师8人；持有船长证书的有4人。在校本科生1137人，各类成人教育学生740人。
航海技术专业培养符合国际海船适任标准要求，能胜任船舶驾驶及营运管理的高级航海技术人才,学院现有的专业具有岗位适任性、国际通用性、法律规定性和国防军事性等显著特点。专业的特殊性决定了学院专业人才培养方案及教学内容和课程体系的特殊性，决定了这类人才必须具有较强的实际动手动脚能力、较宽的知识面、较高的外语水平、较强的为人处世能力、一定的经营组织管理能力。近年来，本学科承担国家、省、市级等科研项目的研究与开发工作。在船舶操作智能化，自动避碰、卫星导航、AIS、VDR、交通信息工程及控制、航运管理等领域的研究成果受到国内同行的广泛关注，并成功研制居国内先进水平的“天文导航仪”、“船舶操作信息自动记录仪”等导航仪器。研制的“GMDSS模拟器”通过了交通部的鉴定，并已教学使用多年，取得了较好的经济与社会效益。完成了“厦门港及附近水域船舶交通管理系统应用研究”、“台湾海峡RBN/DGPS系统误差数学模型及精度改进方法的研究”等省、市科研项目的研究工作.